Assistée des experts étrangers, l’enquête sur les causes du crash se poursuit, conduite par le bureau de sécurité de l’aviation. C’est donc cet organisme qui produira le rapport final sur les causes et responsabilités qui ont conduit à la mort de 48 personnes le soir du 23 juillet aux abords de l’aéroport Makung des Pescadores. Une information confirmée aujourd’hui par le directeur adjoint du bureau de l’aviation civile, Alan Lee (Lee Wan-li) : « Quant à savoir qui est responsable, qui a commis ou non une erreur, je pense que tout cela sera entièrement soumis à l’enquête du bureau de sécurité de l’aviation. Je suis sûr qu’il nous donnera un compte rendu de tout cela. Nous n’avons jamais pointé les pilotes. Je tiens à le répéter, tout ce dont nous avons parlé jusqu’à présent n’a concerné que le niveau de nos critères. »
Une première hypothèse a déjà été écartée, celle concernant une défection du système d’atterrissage aux instruments de l’aéroport qui aurait été frappé par un éclair : « Il a été touché par un éclair dans l’après-midi mais à 17h22, il avait déjà été réparé. Nous savons tous que l’incident a eu lieu le soir vers 19h, à 19h06 environ. Cela n’a rien à avoir avec ce problème »